Dell'antica fabbrica medioevale la chiesa, ad aula unica, conserva l'arco a sesto acuto che immette nel presbiterio sormontato da una volta a crociera del trecento come le volte ancora ben conservate nel chiostro adiacente. Ad inizi '900, durante i lavori di ripristino del pavimento, vennero scoperte le pietre sepolcrali, sulla pavimentazione del cinquecento, di alcune delle famiglie del ceto civile caiatino che avevano scelto S.Francesco per erigere i propri altari di patronato.

Entrando nel chiostro, caratterizzato dalle volte a crociera e da archi a sesto acuto a sostegno degli ambulacri dell’antico convento, è ben visibile all'incrocio di due lati del quadrilatero, l'antico campanile in stile gotico diviso in cinque sezioni chiuse da un tamburo ottagonale con quattro bifore nella penultima sezione.

Il palazzo è facilmente accessibile a tutti, grazie alla presenza di scale, rampe ed ascensori.